牛羊肉片是当今中国最消費较广泛的肉一种生活，牛羊肉片产品取决消費者买策略。屠宰场后腹肌结构受损细胞核系開始经厉各种形态的死忙，如萎缩、凋亡、焦亡和自噬，这些是腹肌还原成为肉的第1步，这一项环节几率会导致好几回系列的繁杂的生物化学反映。铁死忙是前段时间在保鲜牛羊肉片中知道的一种生活受损细胞核系死忙环节，其介导的球脂肪酸阳极氧化和受损细胞核系死忙几率会影响腹肌产品，但其新机制尚不很明白。

2023年9月26日，宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry（IF=8.8）上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外，化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生态学 为其提供 TMT蛋清组学 的检测与分析，发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。

本文名字：TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration（FOOD CHEM.，IF=8.8，2023.09） 企业客户政府部门：内蒙古师范大学 调查材质：牛肉片 组群数据：有所不同冷冻精力的样品全身肌肉聚集 拜谱保证工艺：TMT蛋白酶质组学

PART 01

研发效果

科学研究人群探求现在冷库周期延缓羊肉的密度、持水力发电、成色、自由铁分量、ROS、脂质过钝化物、MDA、GSH和GPX4程度来考评脂肪组织性组织受损细胞的铁自杀睡眠状态。但是呈现，冷库周期延缓后，羊肉的密度在第四天和第6天更为明显走低；持水作用降低了；本色变深，损失光泽感，鲜黄色转成暗黄色。再者，自由铁、活力性氧和MDA的分量更为明显多，组织受损细胞凋亡率更为明显增加。 研究数据研究师截取有一定的差异 保鲜用时的背部胸肌样本的血清酶质，以后做SDS-PAGE数据研究，血清酶质条带在有一定的差异 五代十国时期分布点不规则且相仿（图1a）。可根据血清酶在有一定的差异 样本中的表述前提，数据研究表明某个组样本的中个数贴近于某个横向（图1b），说明书怎么写背部胸肌样本血清酶质具备有优良的组内相仿性和组间一定的个体差异聊天。 球营养素组学共签定会出1996种球营养素。以B0为相较比较组，建立B1、B2、B4和B6中的球淀粉酶质含量参与相互影响表明阐述，共签定会到376个DEPs。将火山图数据可视化，并跟据FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.053个标准单位阐述DEP。报告如同1c-f所展示，在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分头别签定会出22、33、73和140个DEPs，其中的分头别上涨6、11、32和89个，调低16、22、41和54个。聚类分析步骤开展了地域差异速冻周期肌肤进行中球营养素的表明，报告展示肌肤球淀粉酶质含量表明相互影响渐渐永久保存耗时的加大而加大（图1g）。

图1| 有差异 食品冷藏期限的肌群样板蛋白质组学(图源：Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)

继而的设计职工对地域差异血清开始微生态学问题学浅析，GO用语可分为微生态学时（BP）、碳原子的效果(MF)和内部因素(CC)。长为2如图，BP组的DEPs关键参予内部时(148)、消化吸收时(116)、微生态学调试(78)、微生态学时调试(74)和对畅快的反响(57)。MF组的DEPs关键参予组合(114)、促使化学活化(75)等。CC组的DEPs关键设及内部生理实际(171)和含血清符合物(56)等。以便在碳原子质量上系统阐述DEPs在内部和微生态学体中的的效果和信号环路，的设计职工将DEPs生物含有的KEGG信号环路开始注脚和技术鉴定。图2b表示了前20个生物含有信号环路，是指铁去世、亨廷顿病、肌坏死性侧索固化症、中枢神经转性-多见性发病信号环路、碳消化吸收、柠檬百香果酸循环系统系统(TCA循环系统系统)和钝化磷硝化作用。之中，参予铁去世行业的DEPs有16个。 考虑到进步探秘与铁死想关的信号信号通路相护效用，对签别的14个DEPs参与了KEGG信号信号通路定性分享。参加的铁死的前20条想关手段（图2c）主耍的收录血肿瘤组织体细胞核全整个全过程、环境消息处理、分解和空压机平台。铁死是血肿瘤组织体细胞核苍老和消亡的关键全整个全过程。中仅315个异同表达方式的蛋清参加的了共要38条手段（图2d）。蛋清相护效用定性分享认为，除VDAC3和PRNP外，那些蛋清相护效用调低铁死（图2e）。对已签别的与铁垂下去关于的DEPs参与亚血肿瘤组织体细胞核定位手机定性分享，看见与铁死关于的分解全整个全过程主耍的形成在血肿瘤组织体细胞核质、内质网、线粒体、膜、高尔基体和血肿瘤组织体细胞核外区（图2f和g）。

图2| 的不同冷藏库时期的肌肉组织备样的差异淀粉酶探讨(图源：Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)

学习人基于TMT化学发光法了解蛋清酶质组学了解然而，决定19个加入铁伤亡视频国家宏观调控的蛋清酶做好PRM化学发光法了解验正。如表1如下，每一蛋清酶一次有效一必然性肽段，在蛋清酶的一个性和丰度特殊要求，可以通过PRM用对方肽情节的化学发光法了解统计资料做好验正。然而得知与TMT化学发光法了解蛋清酶测定法一致，加入铁伤亡视频路线的15种蛋清酶的阳离子丰度影响新趋势一致，有8种DEPs调整，7种DEPs调低。

表1 铁阵亡球蛋白肽的PRM按量定性分析(表源：Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)

总的说，铁淀粉酶平行的影响（图3）显示它在空调制冷的全阶段中被溶解了。HMOX1的上涨显示在冷库的全阶段中发生的了血红色素溶解。PCBP2平行的影响阻止了FPN介导的 Fe2+易位的全阶段。不但，更改到内部外腔室的 Fe2+在铜蓝藻的效应下较快转变成为 Fe3+，与转铁淀粉酶搭配的 Fe3+能够 TBITFR1符合物更改到内部内腔室，或者造成的内部内PCBP1/2平行的影响。PCBP1和PCBP2淀粉酶表示平行影响，显示与 Fe2+大原子的搭配的全阶段减小，这也促使了 Fe2 +在内部内的沉积。GSH平行影响显示GPX4用途减退，或者造成的铁生亡的全阶段增进，同時ROS平行取得增大，ROS平行增大温馨提示相关胸肌进行抗防防硫化效果减退，相关胸肌进行防防硫化增进。CSL4和LPCAT3淀粉酶平行增大，显示AA条件被成功激活，脂质过防防硫化代谢物丙二醛平行增大。脂质是相关胸肌的非常重要组成的局部，也是相关胸肌模式中药剂学特性最不稳定性的因素一种，铁生亡条件能够 内部膜防防硫化介导内部生亡。

图3| 特征提取KEGG聚集不同之处形容球蛋白的铁阵亡机能(图源：Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202

PART 02、拜谱个人心得体会

作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs，包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外，通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析，发现了37条代谢途径，通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角，可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱海洋生物提供了TMT定量分析核淀粉酶质含量组学方法服务保障的，拜谱生物技艺已研发项目管理搞定并形成了建全完善的转录组学、核淀粉酶组学、代谢率组学及两组学联席厂品方法服务保障的管理体系，欢迎致电咨询！

参考选取文献资料：Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.