
2023年4月2日,西班牙科尔多瓦大学Tomas Cerdo等人在Cell Host & Microbe(IF=30.3, 2023)杂志发表了题为“Infant gut microbiota contributes to cognitive performance in mice”的文章。研究人员使用16S rRNA测序、宏蛋白质含量质组学和代谢转化组学探讨揭示了婴儿认识和肠道菌群之间的联系。结果显示认识能力较好的婴儿肠道菌群可以增强小鼠的记忆,并调节了小鼠外周血皮层(PRC)的组氨酸代谢组,这些结果表明“肠脑轴”在婴儿时期就起到至关重要的作用。
英语怎么说微信标题:Infant gut microbiota contributes to cognitive performance in mice (Cell Host & Microbe,IF=30.3, 2023)
中文字幕宝贝标题:婴儿肠道微生物群有助于小鼠的认知表现
组学技术性:16S rRNA+宏蛋白质组学+代谢组学
范本数据信息:婴儿粪便、小鼠粪便
钻研设想
(图源:Tomas Cerdo, et al., Cell Host & Microbe. 2023)
注意分析的结果
01、宝宝认得意识和肠管菌群设备构造的问题
首先,研究人员基于贝利婴儿发育量表(BSID-III)数据,根据6个月大的婴儿在复合认识、语言和运动三个领域的得分,将婴儿分为高于中位数组和低于中位数组。通过对婴儿粪便样本进行16S rRNA分析,发现唯一与肠道微生物群落结构密切相关的BSID-III量表是复合认识(CC)。 与远远超出CC中五数字组(Inf-belowCC)的婴幼儿相对比,远远超出CC中五数字组(Inf-aboveCC)的婴幼儿肠管菌群极具更加高的匀性( 图1A)。在属水平上,Inf-aboveCC组的肠道菌群中杆菌、链球菌、拟副杆菌、严格感梭菌、霍氏杆菌和瘤胃球菌富集,而无毛螺科、嗜血杆菌和乳球菌的显著减少(图1B-D)。上述结果表明, 交往力有不一致性的孩子,其肠子微怪物在群落的结构本质特征上来源于为显著不一致性 。
图1. Inf-aboveCC和Inf-belowCC组新生宝宝可以使肠胃菌分组成结构类型
02、婴孩认识到力量有关的宏淀粉酶质组显著特点
为了探究与婴儿认识相关的肠道菌群功能特征,研究人员采用宏蛋白酶质组学对婴儿粪便进行分析。结果表明,Inf-belowCC组的肠道菌群富含参与细胞内运输分泌和囊泡运输的蛋白质,而Inf-aboveCC组中参与碳水化合物运输和代谢的蛋白质有增加的趋势。稀疏偏最小二乘判别分析(sPLS-DA)图显示,婴儿宏蛋白质组(图2A)和促进区分的已鉴定蛋白质组(图2B)之间存在明显区别。组氨酸酶(HutH)是Inf-aboveCC宏白质组中绝无仅有同质性含有的血清质。随后,研究人员通过DESEq2差异丰度分析(图2C)和Wilcoxon检验进一步证实了上述结果,组氨酸分解代谢的两种下游酶尿糖酸脱水酶(HutU)和咪唑酮丙酸酶(HutI)在Inf-above CC宏蛋白质组中丰度较高。上述分析结果揭示了与婴儿认识能力相关的宏蛋白质组特征。
图2. 宏蛋白酶质组学丰度介绍
03、组氨酸分解代谢与产品自我意识实力相关联
宏蛋白质组学数据和生化实验结果表明婴儿组氨酸代谢与认识能力相关,因此,研究人员开发一种靶向药物分解代谢组学方法用于定量分析组氨酸代谢物水平(图3A)。结果表明Inf-aboveCC组婴儿粪便中的尿酸盐水平显著降低,而其余组氨酸代谢物则无差异(图3B)。研究人员进一步检测了婴儿尿液中的组氨酸代谢物,结果显示与Inf-belowCC相比,Inf-aboveCC组婴儿尿液中组胺、组氨酸和尿酸水平显著升高(图3C),且Inf-aboveCC组粪便中的尿酸盐/组氨酸比值(图3D)和尿液中的组胺/尿酸盐比值(图3E)显著降低。粪便中的尿酸盐/组氨酸比值与unclass_lachnospirace_41和Lachnospiraceae incertae sedis属呈负相关,与Bacteroides_3呈正相关(图3F)。尿液中的组氨酸水平与Streptococcus_42和Bacteroides属呈正相关,而尿酸水平与Holdemanella_16呈负相关,与链球菌属呈正相关(图3G)。
图3. 组氨酸分解与新生婴儿社会认知技能关干
04、婴孩供体的肠子菌群小鼠复制
最后,为了调查肠道微生物群是否有助于认知,研究人员进行了一项粪便微生物群移植(FMT)实验。结果表明,将Inf-aboveCC供体的粪便移植到GF小鼠体内,其记忆功能优于Inf-belowCC供体的小鼠(图4)。被婴儿肠道菌群定植的小鼠拥有与记忆功能相关的不同细菌分类群,认知表现较好的婴儿微生物群小鼠表现出更高的记忆功能,包括Phocaeicola, Bacteroides和Bifidobacterium物种在内的丰富分类群以及不同的组氨酸代谢组学特征(图4B),其中,毛缕菌科和拟杆菌类与婴儿认知的关联在人源化小鼠中得到了复制。此外,与接受Inf-belowCC肠道微生物组的小鼠相比,学习Inf-below cc胃肠微海洋生物组的小鼠HutH活力通常会更快。总之,这些结果表明通过婴儿供体的肠道菌群粪便移植的记忆功能可以传播给GF小鼠,表明肠道菌群可以作为一种促进记忆的实体。
图4. 被幼儿肠内菌群定植的小鼠有了与记忆里效果涉及到的不同于疾病的分类群
总结
上述讲到,钻研人数在16S rRNA测序、宏血清质组学和产生组学具体分析制定了幼儿组氨酸产生组与交往程度区间内的结合,隐性现新一个与交往效率相关的的产生酶—组氨酸酶(HutH)。HutH技术平行的对比分析同时各个的粪渣和尿样组氨酸产生组与幼儿交往程度有观。显然,在幼儿供体的胃胃肠菌群粪渣试管种植的記憶特点就可以网络传播给灭菌小鼠,交往效率最好的幼儿供体试管种植小鼠蕴含Phocaeicola, Bacteroides和Bifidobacterium等与交往程度效率有观的菌。钻研阐明幼儿分手后复合交往程度和胃胃肠菌群聊成区间内的相关时间最早在6月时就制定下去了,组氨酸产生物技术平行的调节器都是种隐性的工作机制。拜谱个人心得体会
本研究通过16S rRNA测序和宏血清质组学分析使组氨酸酶在婴儿认识中的作用脱颖而出,并通过代谢组学和粪便移植的方法进一步验证,着力表述了在婴孩-猪粪移殖小鼠系统中胃肠菌群对了解性能的影向,为“肠脑轴”在婴孩阶段的不断发展和做用规则供应了新的认识。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供蛋白质组学、代谢组学、修饰组学、16S rRNA测序等多组学技术,结合组学技术拜谱生物也推出了针对不同样本和研究领域的多组学研究方案,包括肠道篇、血液篇、医学篇等,帮助客户解决研究难题,助力多篇高分文章的发表,欢迎大家咨询!
参考使用论文资料:Tomas C, Alicia RR, Inmaculada A, et al. Infant gut microbiota contributes to cognitive performance in mice. Cell Host & Microbe. 2023, 31(12): 1974-1988. doi: 10.1016/j.chom.2023.11.004.