草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿软件体统常用见的重大疾病的一种。肾机构中CaOx尖晶石过饱和点磨合会出现肾小管血细胞问题和凋亡，然而出现肾结石的型成。短链皮下脂肪含量酸由胃肠内内好氧池细菌病毒厌氧发酵饮食钎维会产生，不仅仅在部分胃肠内第一道防线中树立目的，还在软件体统品质上也树立重中之重目的。各举，丁酸是最多样化的短链皮下脂肪含量酸，具备着免疫力减缓和免疫力减缓目的,本研究研究丁酸对CaOx肾结石的目的以及其风险靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山机构泌尿产科吴忠讲师、周子健硕士生于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠先生、周子健博士后在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生态学与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了网上药理学学产品，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

本文品牌：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 消费者方：华山医院门诊 研究探讨另一半：大鼠、HK-2组织 组群资料：对比组（Con）、实体模型组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱给出技能：网站药理学学监测

总体目标方案图

研究方案的结果

深入分析员工首选倡导大鼠3d绘图工具，使用生理特点生物化指数和组织性病检学印染等深入分析技术看见丁酸可以极大减少CaOx3d绘图工具大鼠肾CaOx纳米线的造成和伤到，纠正CaOx3d绘图工具大鼠的感染伤到和氧化物反应元素的过快表现。还有，丁酸还可遏制草酸诱发的HK-2細胞伤到、氧化物反应应激反应和細胞凋亡。 为理论研究性学习丁酸设备构造和靶人类表观遗传在线，理论研究工人从PubChem得丁酸和丁酸酯的二维和3d设备构造（图1A）。来进行PharmMapper数值显示库和Uniprot数值显示库整理后共建立出1115个丁酸靶人类表观遗传供进1步探讨。将人类表观遗传全部添加STRING数值显示库，来进行PPI在线探讨。Cytoscape提供了顺序排列的前20的核心靶人类表观遗传的详实在线图，包含CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。这个核心人类表观遗传与在线中的其余人类表观遗传均表面出一定的的对应联性，阐明这个人类表观遗传或者树立着推进发应。GO和KEGG探讨证明了丁酸核心人类表观遗传的对应联条件和微生物体学效果（图1C）。核心人类表观遗传首要与类固醇生长肾上腺素回话、硫化发应应激反應发应回话、催化几丁质酶氧血细胞对类固醇生长肾上腺素多种多样的发应、对酸碱性微生物物品的发应有关系。上述情况所写，这个核心人类表观遗传首要加入了硫化发应应激反應发应和对催化几丁质酶氧的微生物体发应过程中 ，是肾结石转变成原则中至关主要的条件，这反映丁酸或者在肾结石中树立主要发应。

图1| 丁酸结构设计与靶遗传基因网络上剖析(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进那步科学探索丁酸对CaOx肾结石着实切靶表观遗传，探析剖析员工利用GEO数据分析资料库对GSE73680中绿色健康對照与CaOx肾结石朋友的表观遗传不同去了探析剖析。對照组与CaOx结石朋友的重要性系数性不同理解表观遗传（DEGs）DNA组组检测标准化为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共选择到3783个表观遗传的发生重要性系数转变，各举3379个（89.4%）表观遗传理解调涨，404个（10.6%）表观遗传理解下跌（图2A）。对DEGs去聚类算法算法剖析，热图显现了前10个被选中DEGs的二维分出层次聚类算法算法表现（图2B）。随后不久，探析剖析员工完成GeneCards数据分析资料库人造评定了370个概率与CaOx肾结石重要性的表观遗传，排明前20位的预侧表观遗传非常重要性性计分如下图2C已知。是为了寻得丁酸医疗CaOx肾结石的主要靶点，探析剖析员工将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石重要性表观遗传办理取得一个Venn图。进而，CYP2C9被敲定为丁酸后果CaOx肾结石的潜在性靶点(图2D)。还有就是，探析剖析员工还去了丁酸与CYP2C9的氧分子接管，CYP2C9的六个胺基酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸彼此做用，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在利用网格药理学学分折CYP2C9是丁酸的影响CaOx肾结石的靶表观遗传后，论述人还在体細胞研究验证了CYP2C9可较低草酸诱导性的HK-2体細胞的ROS品质、支原体感染破损和凋亡。

图2| 往往据库联合技术研究分析预測CYP2C9是丁酸目的于CaOx肾结石的靶什么是基因

研发结论

本探析一方面得知丁酸在机体和机体均能治理和改善CaOx肾结石模板的被被氧化应激反应反应和支原体感染板材损害，其次采用网咯药理学学学淘汰赢得丁酸作用CaOx肾结石的未知靶点——CYP2C9，接下来采用组织实验性查证CYP2C9在草酸盐帮助的HK-2组织ROS能力、支原体感染板材损害和凋亡。这个得知表面丁酸将会采用治理和改善CYP2C9来治理和改善CaOx肾结石的被被氧化应激反应反应，减弱支原体感染板材损害。这进程中拜谱菌物体出具了网咯药理学学学的技术工艺功能，于此拜谱菌物体可提升 比较成熟不断完善的染色体组学、蛋白酶质组学、代谢转化组学等几组学物料及的技术工艺功能，喜欢网络咨询网络咨询！ 对比资料：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.